Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nid2O88322 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nid2O88322 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nid2O88322 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nid2O88322 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nid2O88322 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nid2O88322 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nid2O88322 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nid2O88322 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nid2O88322 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nid2O88322 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nid2O88322 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nid2O88322 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nid2O88322 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nid2O88322 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nid2O88322 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nid2O88322 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nid2O88322 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nid2O88322 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nid2O88322 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nid2O88322 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nid2O88322 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nid2O88322 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nid2O88322 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nid2O88322 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nid2O88322 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Nid2O88322 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nid2O88322 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nid2O88322 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nid2O88322 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nid2O88322 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nid2O88322 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nid2O88322 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nid2O88322 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nid2O88322 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nid2O88322 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nid2O88322 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nid2O88322 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nid2O88322 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nid2O88322 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms