Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6aO35464 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6aO35464 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6aO35464 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6aO35464 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6aO35464 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6aO35464 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms