Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tcof1O08784 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tcof1O08784 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tcof1O08784 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tcof1O08784 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcof1O08784 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcof1O08784 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcof1O08784 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcof1O08784 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcof1O08784 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcof1O08784 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tcof1O08784 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcof1O08784 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tcof1O08784 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms