Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17577J3QNF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17577J3QNF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17577J3QNF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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