Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip12G5E870 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip12G5E870 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip12G5E870 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip12G5E870 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip12G5E870 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip12G5E870 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip12G5E870 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms