Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933406M09RikG3XA12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
4933406M09RikG3XA12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4933406M09RikG3XA12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933406M09RikG3XA12 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
4933406M09RikG3XA12 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933406M09RikG3XA12 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933406M09RikG3XA12 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms