Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Ercc6F8VPZ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Ercc6F8VPZ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Ercc6F8VPZ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Ercc6F8VPZ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Ercc6F8VPZ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Ercc6F8VPZ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Ercc6F8VPZ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Ercc6F8VPZ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Ercc6F8VPZ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Ercc6F8VPZ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Ercc6F8VPZ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ercc6F8VPZ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Ercc6F8VPZ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Ercc6F8VPZ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ercc6F8VPZ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ercc6F8VPZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ercc6F8VPZ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Ercc6F8VPZ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Ercc6F8VPZ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Ercc6F8VPZ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Ercc6F8VPZ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Ercc6F8VPZ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Ercc6F8VPZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Ercc6F8VPZ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Ercc6F8VPZ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ercc6F8VPZ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Ercc6F8VPZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms