Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ttc37F8VPK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ttc37F8VPK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ttc37F8VPK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ttc37F8VPK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ttc37F8VPK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ttc37F8VPK0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ttc37F8VPK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ttc37F8VPK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ttc37F8VPK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ttc37F8VPK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ttc37F8VPK0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ttc37F8VPK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ttc37F8VPK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Ttc37F8VPK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Ttc37F8VPK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ttc37F8VPK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ttc37F8VPK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ttc37F8VPK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ttc37F8VPK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Ttc37F8VPK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ttc37F8VPK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ttc37F8VPK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ttc37F8VPK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms