Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl9F7BE40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arl9F7BE40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arl9F7BE40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl9F7BE40 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl9F7BE40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arl9F7BE40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arl9F7BE40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl9F7BE40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arl9F7BE40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arl9F7BE40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Arl9F7BE40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms