Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3110082J24RikF6Z6Z2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3110082J24RikF6Z6Z2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3110082J24RikF6Z6Z2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3110082J24RikF6Z6Z2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3110082J24RikF6Z6Z2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3110082J24RikF6Z6Z2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
3110082J24RikF6Z6Z2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
3110082J24RikF6Z6Z2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms