Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933403O08RikF6UK53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933403O08RikF6UK53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933403O08RikF6UK53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933403O08RikF6UK53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933403O08RikF6UK53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms