Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Phldb3E9QAF4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Phldb3E9QAF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Phldb3E9QAF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Phldb3E9QAF4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Phldb3E9QAF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Phldb3E9QAF4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Phldb3E9QAF4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Phldb3E9QAF4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phldb3E9QAF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phldb3E9QAF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Phldb3E9QAF4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phldb3E9QAF4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms