Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm20425E9Q035 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm20425E9Q035 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm20425E9Q035 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm20425E9Q035 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm20425E9Q035 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm20425E9Q035 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm20425E9Q035 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm20425E9Q035 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm20425E9Q035 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm20425E9Q035 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm20425E9Q035 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms