Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AU018091E9PWS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU018091E9PWS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU018091E9PWS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU018091E9PWS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU018091E9PWS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AU018091E9PWS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AU018091E9PWS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms