Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
4930407I10RikD3Z5T8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
4930407I10RikD3Z5T8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
4930407I10RikD3Z5T8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
4930407I10RikD3Z5T8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
4930407I10RikD3Z5T8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
4930407I10RikD3Z5T8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
4930407I10RikD3Z5T8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
4930407I10RikD3Z5T8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
4930407I10RikD3Z5T8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
4930407I10RikD3Z5T8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
4930407I10RikD3Z5T8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
4930407I10RikD3Z5T8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
4930407I10RikD3Z5T8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
4930407I10RikD3Z5T8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
4930407I10RikD3Z5T8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
4930407I10RikD3Z5T8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
4930407I10RikD3Z5T8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
4930407I10RikD3Z5T8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
4930407I10RikD3Z5T8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
4930407I10RikD3Z5T8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
4930407I10RikD3Z5T8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms