Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprz1B9EKR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptprz1B9EKR1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprz1B9EKR1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptprz1B9EKR1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptprz1B9EKR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptprz1B9EKR1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptprz1B9EKR1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptprz1B9EKR1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms