Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tex28B1AYN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tex28B1AYN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tex28B1AYN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tex28B1AYN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tex28B1AYN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tex28B1AYN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tex28B1AYN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tex28B1AYN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms