Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtpruB1AUH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtpruB1AUH1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtpruB1AUH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtpruB1AUH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtpruB1AUH1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtpruB1AUH1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtpruB1AUH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtpruB1AUH1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtpruB1AUH1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtpruB1AUH1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtpruB1AUH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtpruB1AUH1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtpruB1AUH1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PtpruB1AUH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PtpruB1AUH1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtpruB1AUH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtpruB1AUH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtpruB1AUH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtpruB1AUH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtpruB1AUH1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtpruB1AUH1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtpruB1AUH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtpruB1AUH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtpruB1AUH1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.78■■■■□ 3
PtpruB1AUH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195 ms