Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt3B0QZW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt3B0QZW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt3B0QZW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt3B0QZW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt3B0QZW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt3B0QZW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt3B0QZW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt3B0QZW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt3B0QZW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms