Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint8A7XV07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint8A7XV07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint8A7XV07 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skint8A7XV07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skint8A7XV07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint8A7XV07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skint8A7XV07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skint8A7XV07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint8A7XV07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint8A7XV07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skint8A7XV07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms