Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skor2A7M7C7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skor2A7M7C7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor2A7M7C7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Skor2A7M7C7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skor2A7M7C7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skor2A7M7C7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skor2A7M7C7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor2A7M7C7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms