Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Palm3A2TJV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Palm3A2TJV2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Palm3A2TJV2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Palm3A2TJV2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Palm3A2TJV2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Palm3A2TJV2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Palm3A2TJV2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Palm3A2TJV2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Palm3A2TJV2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Palm3A2TJV2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Palm3A2TJV2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Palm3A2TJV2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Palm3A2TJV2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Palm3A2TJV2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Palm3A2TJV2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms