Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrg1A2BFE8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrg1A2BFE8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrg1A2BFE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrg1A2BFE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prrg1A2BFE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrg1A2BFE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrg1A2BFE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrg1A2BFE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrg1A2BFE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms