Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YD17

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YD17 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YD17 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A286YD17 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A286YD17 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A286YD17 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YD17 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YD17 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A286YD17 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YD17 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YD17 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A286YD17 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YD17 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A286YD17 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A286YD17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A286YD17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A286YD17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A286YD17 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A286YD17 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A286YD17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YD17 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A286YD17 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A286YD17 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A286YD17 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A286YD17 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A286YD17 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms