Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn2aA0A0J9YTW6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn2aA0A0J9YTW6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn2aA0A0J9YTW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms