Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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