Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402E13RikQ9D4D2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms