Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OxsmQ9D404 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OxsmQ9D404 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OxsmQ9D404 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OxsmQ9D404 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms