Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms