Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms