Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms