Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd3Q52KB6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms