Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bop1P97452 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bop1P97452 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms