Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB7

Rnf141, RING finger protein 141, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf141Q99MB7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms