Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.6Q85ZW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms