Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp444Q3TDV8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms