Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capza1P47753 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capza1P47753 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms