Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP4Q8N2S1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP4Q8N2S1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP4Q8N2S1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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