Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q08AU9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q08AU9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q08AU9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q08AU9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q08AU9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q08AU9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q08AU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q08AU9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q08AU9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q08AU9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q08AU9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q08AU9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q08AU9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q08AU9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q08AU9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q08AU9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q08AU9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms