Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms