Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bbip1J3QMK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms