Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx12Q9ER00 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms