Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms