Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa11P50709 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa11P50709 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms