Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms