Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ARID3CA6NKF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms