Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco4Q9JIS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms