Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmod1P49813 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod1P49813 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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