Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa11P50709 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms