Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm4491E0CX42 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm4491E0CX42 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm4491E0CX42 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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